Аналитический центр геомагнитных данных межрегионального сегмента ИНТЕРМАГНЕТ функционирует на базе Геофизического центра Российской академии наук (ГЦ РАН). В Центр передаются данные из геомагнитных обсерваторий и станций, расположенных на территории России и стран ближнего зарубежья. Центр также обеспечивает доступ к данным спутниковых измерений. Аппаратно-программный комплекс МАГНУС лежит в основе работы Центра. Его отличительной особенностью является автоматизированное распознавание искусственных (техногенных) возмущений на магнитограммах по мере их поступления. Такая система контроля качества, созданная впервые с применением аппарата нечеткой логики для геомагнитных измерений, облегчает экспертам подготовку окончательных магнитограмм из предварительных записей. АПК МАГНУС также осуществляет оперативную многокритериальную оценку геомагнитной активности с использованием набора индикаторов и предоставляет онлайн-средства моделирования электромагнитных параметров околоземного пространства.

Другой особенностью Центра является хранение накапливаемых геомагнитных данных при помощи реляционной системы управления базами данных. Геомагнитная база данных предназначена для хранения как минутных, так и секундных данных. Результаты распознавания техногенных и естественных возмущений магнитного поля также хранятся в базе данных.

Развитие сети наземных наблюдений магнитного поля Земли и поддержка работы Центра полностью согласуются с Резолюцией №4 (2009), Резолюцией №5 (2009) и Резолюцией №2 (2013) Международной ассоциации геомагнетизма и аэрономии (IAGA).